Die Baukommission ist eine Kommission des Stadtrates mit selbständigen Verwaltungsbefugnissen. Gemäss Anhang 1 „Wahlkompetenzen“ der Gemeindeordnung (GO) der Stadt Kloten werden die Mitglieder der Baukommission durch den Stadtrat gewählt. Den Präsidenten wählt der Stadtrat aus seiner Mitte (Art. 30 Abs. 1 lit. c GO). Neben dem Präsidenten besteht die Baukommission aus vier Mitgliedern (Art. 51 Abs. 2 GO).